2023년 7월 15일, 2차 종합특별검사팀이 서울~양평고속도로 노선 변경 의혹과 관련하여 원희룡 전 국토교통부 장관에 대한 압수수색을 실시했다. 압수수색 영장은 이날 오전 집행되었으며, 원 전 장관의 신체 및 차량에서 휴대전화가 압수된 것으로 전해졌다.
이번 수사는 원 전 장관이 직권남용 권리행사방해 혐의를 받고 있는 상황에서 진행되었다. 특검팀은 압수수색 현장에서 원 전 장관에게 출석요구서를 전달하였으며, 현재 출석 일자를 조율 중인 것으로 확인되었다.
앞서 특검팀은 원 전 장관에게 두 차례 출석 소환 통보서를 보냈으나, 모두 폐문부재로 송달되지 않았다.특히, 이번 사건의 핵심은 2023년 국토부가 서울∼양평고속도로 사업의 종점 노선을 당초 양서면에서 김건희 여사 일가의 땅이 위치한 강상면으로 변경하였다는 의혹이다.
원안은 2021년 예비타당성 조사를 통과했으나, 2023년 5월 국토부가 새로운 노선 검토를 시작하면서 특혜 의혹이 불거졌다. 이에 따라 원 전 장관은 같은 해 7월 사업 백지화를 선언하였으나, 그 과정에서 적법 절차를 거치지 않았다는 의혹이 제기되고 있다.
종합특검팀은 원 전 장관이 백지화 선언 및 관련 보도자료 배포 과정에서 법 위반 소지가 있음에도 불구하고 이를 무시한 정황을 확인했다. 원 전 장관은 그동안 노선 검토 업무에 관여한 사실이 없으며, 자신이 할 수 있는 유일한 선택은 모든 노선 검토 결과를 백지화하고, 여야 합의로 노선검증위원회를 구성하여 최적의 노선을 결정하는 것이라는 주장을 여러 차례 밝혔다.
원 전 장관은 혐의를 강력히 부인하며, 특검팀의 수사에 대해 비판적인 입장을 취하고 있다.